110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0594 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  46.35 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  43.28 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  43.37 
 
 		 202 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  43.57 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  52.21 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  37.8 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  42.41 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  43.64 
 
 		 197 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  42.64 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  52.11 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  42.24 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  39.57 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  39.87 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 267 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  43.79 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  39.05 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  41.91 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  41.91 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  40.28 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  39.01 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  39.1 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  42.96 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  31.38 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.99 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  31.91 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.55 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  34.87 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  31.78 
 
 		 326 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  34.46 
 
 		 306 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  45.56 
 
 		 519 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.08 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  34.46 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 323 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 319 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  36.48 
 
 		 339 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  27.4 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  32.33 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  37.5 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  29.23 
 
 		 322 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  27.14 
 
 		 321 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 303 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 426 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 314 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  24.82 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  34.93 
 
 		 361 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 319 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  25.9 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  28.89 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0880  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 288 aa  45.1  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  30.14 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.89 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 347 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.02 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>