105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4419 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  100 
 
 		 255 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  79.22 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  46.88 
 
 		 193 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  41.58 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  49.26 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  45.16 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  42.36 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  42.65 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  43.21 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  38.64 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  37.8 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  41.61 
 
 		 179 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  37.57 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  41.06 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  48.31 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  48.53 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  38.55 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  40 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  38.82 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  38.24 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  44.44 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  32.65 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  46.02 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  40.19 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  45.87 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  45.87 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  50.7 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  33.56 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  48.54 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  28.38 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  26.8 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.16 
 
 		 643 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.69 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.2 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 426 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  34.81 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.97 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  23.45 
 
 		 311 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  42.65 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  22.17 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  37.04 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  24.66 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  38.98 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 342 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  32.73 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  42.28 
 
 		 165 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 319 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 323 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 301 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  27.53 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.92 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  32.73 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.84 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  26.03 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  25.66 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  22.29 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  29.25 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.8 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  23.88 
 
 		 311 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  34.35 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  24.67 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  26.71 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  24.67 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>