99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0479 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  100 
 
 		 165 aa  300  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  42.75 
 
 		 200 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  40.58 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  42.96 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  43.75 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  39.44 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  42.76 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  42.66 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  43.51 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  39.35 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  42.18 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  39.35 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  39.86 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  38.73 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  40.97 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  41.94 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  44.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  38.06 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  43.8 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  33.12 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 416 aa  57.4  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  38.93 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  34 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 314 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 267 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 319 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 319 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 448 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  30.67 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 318 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 312 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 304 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 291 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.68 
 
 		 326 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 304 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 323 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  32.86 
 
 		 322 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  38.79 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 299 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 303 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 321 aa  47.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 323 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 330 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  31.06 
 
 		 326 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 323 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  22.84 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 310 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  40.35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  22.84 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 294 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 325 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  28.12 
 
 		 315 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  38.41 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 335 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 319 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  41.76 
 
 		 519 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  26.71 
 
 		 313 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 321 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 324 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  27.81 
 
 		 287 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 301 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 320 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.93 
 
 		 321 aa  44.3  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 302 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.64 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 311 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  47.22 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 312 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.43 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  51.43 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.01 
 
 		 643 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 347 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0539  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 312 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 323 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 306 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 306 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  25.87 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 302 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 302 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>