33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13687 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  100 
 
 		 191 aa  352  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  65.58 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  63.98 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  65.16 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  52.78 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  54.55 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  66.45 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  66.45 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  47.59 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  47.06 
 
 		 212 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  47.79 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  40.56 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  40.99 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  47.06 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  42.34 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  37.18 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  41.07 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  38.24 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  39.61 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.86 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  34.29 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  33.79 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  52.24 
 
 		 519 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  36.5 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  27.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  36.42 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  38.62 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 416 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  33.93 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>