61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0621 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  100 
 
 		 179 aa  323  8.000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  53.85 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  34.32 
 
 		 416 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  30.49 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  41.92 
 
 		 339 aa  81.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  32.4 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  43.48 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  49.24 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  41.48 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  40 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  44.96 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  40.88 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  39.57 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  36.42 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  35.67 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  39.73 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  39.07 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  36.84 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33340  Flp pilus assembly protein TadC  51.65 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  35.62 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.59 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  51.85 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  32.7 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  39.62 
 
 		 304 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  33.13 
 
 		 448 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.42 
 
 		 296 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  41.27 
 
 		 306 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  35 
 
 		 302 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  41.27 
 
 		 306 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 319 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 293 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 314 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  33.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  39.29 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  23.26 
 
 		 643 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  24.71 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 294 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  26.32 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 297 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  35.48 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  67.86 
 
 		 519 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  37.14 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  40.38 
 
 		 313 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 307 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 326 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 320 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  54.55 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  54.55 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  54.55 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  24.39 
 
 		 324 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>