36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33340  Flp pilus assembly protein TadC  100 
 
 		 193 aa  351  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  54.36 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  54.22 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  46.95 
 
 		 235 aa  90.9  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  34.94 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  37.59 
 
 		 416 aa  84.3  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  41.91 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  38.51 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  39.02 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  38 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  41.55 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  39.09 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  44.07 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  41.54 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  44.35 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  41.09 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  41.96 
 
 		 361 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 448 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  34.71 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  57.69 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  39.26 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  37.43 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.93 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  36.69 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  26.62 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 329 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 304 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 321 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  73.08 
 
 		 519 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>