40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0731 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  100 
 
 		 267 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  50 
 
 		 197 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  50 
 
 		 202 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  44.14 
 
 		 212 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 185 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  46.67 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  52 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  55.1 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  55.1 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  55.1 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  48.18 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  44.9 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  40 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  41.18 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  38.18 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  36.69 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  44.76 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  42.27 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  36.69 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  36.99 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  35 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  51.61 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  36.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  42.34 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  35.25 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  47.76 
 
 		 519 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  39.04 
 
 		 361 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  23.72 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  26.28 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  31.72 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  40.48 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>