44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0520 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 202 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  61.15 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  47.31 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  53.64 
 
 		 192 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  53.59 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  53.42 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  57.05 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  54.3 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  54.3 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  41.04 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  46.21 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  42.36 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  44.12 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  43.15 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  46.62 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  40.99 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  41.72 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  38.73 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  38.62 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.74 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  34.8 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  40.28 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  39.01 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  37.66 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  47.19 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  34.9 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  51.85 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  34 
 
 		 416 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 319 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  31.17 
 
 		 296 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  31.9 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  36.42 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 314 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.28 
 
 		 321 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  27.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 312 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  21.52 
 
 		 426 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>