35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0278 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  100 
 
 		 185 aa  342  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  46.57 
 
 		 212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  48 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  46.75 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  52.15 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  50 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  46.24 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  53.05 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  53.05 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  47.1 
 
 		 267 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  43.41 
 
 		 255 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  43.9 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  47.26 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  41.86 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  41.27 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  39.69 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  38.06 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  38.35 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  42.76 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  47.76 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  46.43 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  35.54 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  36.19 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  36.92 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  37.98 
 
 		 339 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  24.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  35.17 
 
 		 416 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  53.23 
 
 		 519 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 426 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 294 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  28.47 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.74 
 
 		 295 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>