22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1295 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  32.91 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  35.26 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  33.79 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  31.65 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  31.82 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  32.69 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  32.37 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  29.37 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  28.38 
 
 
255 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  26.49 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  29.71 
 
 
339 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  29.8 
 
 
416 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  42.25 
 
 
361 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  28.29 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  33.78 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  25.81 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  28.77 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  31.3 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  27.63 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  25.36 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  35.37 
 
 
208 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>