150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0216 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  100 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  62.18 
 
 		 193 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  48.37 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  57.93 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  48.2 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  48.03 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  49.21 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  46.43 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  40 
 
 		 448 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  44.53 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  40.96 
 
 		 202 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  37.3 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  39.87 
 
 		 203 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  40.38 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  41.98 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  46.23 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  41.3 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  37.04 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  38.99 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  42.34 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  39.13 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  39.13 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  32.19 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  30.14 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  41.53 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  34.35 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  37.59 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  25.97 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  33.11 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  30.58 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  24.56 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  27.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  28.68 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  35.21 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  24.65 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  37.41 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  40.48 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.29 
 
 		 324 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  29.05 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.87 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2046  putative fimbriae-related membrane protein  30.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1675  type II secretion system protein F  30.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0331  type II secretion system protein F  30.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0097112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0830  type II secretion system protein F  30.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.288216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  28.67 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.11 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.58 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  38.94 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  26.87 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1878  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.650462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1890  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  24.9 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  23.87 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 320 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  23.87 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  31.88 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  25.48 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.64 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 426 aa  48.9  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  33.8 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>