46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0326 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  100 
 
 		 183 aa  331  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  53.19 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  55.74 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  37.09 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  36.17 
 
 		 416 aa  84.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  44.85 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  29.11 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  43.42 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  40.44 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  42.54 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  45.97 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  43.85 
 
 		 255 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  41.78 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.4 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33340  Flp pilus assembly protein TadC  54.05 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  40.56 
 
 		 339 aa  68.2  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  42.14 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  36.91 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  35 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  41.48 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  42.14 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  38.51 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  36.3 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  36.88 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  35.42 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  37.06 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  41.75 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 303 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 307 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  34.01 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  33.96 
 
 		 448 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.46 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 304 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.41 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  43.08 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  26.01 
 
 		 321 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  38.32 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  28.9 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 331 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  34.31 
 
 		 191 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 293 aa  40.8  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>