124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4037 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  100 
 
 		 253 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  79.22 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  42.18 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  48.63 
 
 		 193 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  49.63 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  41.84 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  44.14 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  39.3 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  44.44 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  44.53 
 
 		 212 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  42.68 
 
 		 185 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  48.72 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  44.74 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  42.96 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  49.25 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  37.33 
 
 		 448 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  41.76 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  40.94 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  41.18 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  41.57 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  32.31 
 
 		 311 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  32.57 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  49.56 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  38.62 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  49.54 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  49.54 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  36.15 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  44.16 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  53.73 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  37.4 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  29.05 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  33.56 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  29.03 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.67 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.8 
 
 		 643 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  26.62 
 
 		 326 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 426 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  38.97 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.21 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 319 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 313 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.92 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25 
 
 		 317 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  23.65 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  31.88 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  39.32 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  43.62 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  24.52 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  43.33 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  28 
 
 		 314 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 322 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 323 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.16 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28.72 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  26.03 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.47 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.63 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  28.57 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  40.62 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>