More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3086 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3086  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
667 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.79 
 
 
951 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.88 
 
 
1034 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.56 
 
 
1047 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  28.16 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.67 
 
 
1114 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1303 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 
549 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1646  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.13 
 
 
625 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.71 
 
 
1051 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0205417  normal  0.226343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  35.19 
 
 
938 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1654 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.5 
 
 
935 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.86 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1026 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  32.35 
 
 
1934 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.76 
 
 
783 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.33 
 
 
867 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
935 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  33.61 
 
 
800 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1707  diguanylate cyclase  30.63 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 
1268 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.77 
 
 
1301 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
780 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4345  regulatory protein LuxR  38 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  33.62 
 
 
1187 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.23 
 
 
791 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4714  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 
215 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.41 
 
 
890 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1432 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1237 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2232  two component LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
212 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0978  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.159022  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3579  regulatory protein LuxR  36.46 
 
 
213 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0227422  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 
219 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4862  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 
215 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  28.21 
 
 
901 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
213 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
766 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1961  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
247 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  42.62 
 
 
209 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 
223 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1927 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
219 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
223 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
208 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1749  PAS:GGDEF  28.93 
 
 
476 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0218536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4981  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0985  sensory box protein  32.28 
 
 
976 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.928504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.28 
 
 
886 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1738  response regulator receiver protein  30.57 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
204 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2870  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.07 
 
 
1105 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719713  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 
890 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1548 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1065 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  30.33 
 
 
796 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.19 
 
 
794 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1975  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1907  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.05 
 
 
1013 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.527158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  34.44 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  43.64 
 
 
211 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  42.65 
 
 
216 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
763 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1436 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  50 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
201 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
209 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1076 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>