More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3527 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
667 aa  1356    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  48.35 
 
 
295 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
549 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  41.06 
 
 
509 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  35.6 
 
 
538 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
655 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 
653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  60.67 
 
 
430 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  32.9 
 
 
428 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 
424 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.42 
 
 
653 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  58.44 
 
 
653 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  26.74 
 
 
694 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  56.17 
 
 
290 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 
562 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  64.03 
 
 
388 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  62.59 
 
 
357 aa  165  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
2693 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
428 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  53.64 
 
 
312 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1432 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  58.33 
 
 
271 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
306 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  26.73 
 
 
783 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
315 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  57.25 
 
 
271 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  33.22 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  49.35 
 
 
323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  59.46 
 
 
429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 
439 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50.38 
 
 
272 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
1171 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  47.97 
 
 
638 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  49.43 
 
 
376 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
1654 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  49.31 
 
 
445 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  52.31 
 
 
281 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
1171 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  48.61 
 
 
291 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  46.9 
 
 
293 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
3706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  51.94 
 
 
275 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
907 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
1741 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.14 
 
 
1301 aa  130  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  51.15 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  25.53 
 
 
1268 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  51.61 
 
 
271 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.28 
 
 
1047 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  48.3 
 
 
372 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
971 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  48.84 
 
 
315 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  49.66 
 
 
385 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
1058 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.46 
 
 
919 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
358 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 
288 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  48.48 
 
 
689 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  23.44 
 
 
886 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  25.17 
 
 
1589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
1168 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  47.24 
 
 
357 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 
1965 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.57 
 
 
1051 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0205417  normal  0.226343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 
279 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  48.89 
 
 
283 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  46.03 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  46.05 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  46.26 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  45.14 
 
 
425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.62 
 
 
890 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  46.83 
 
 
272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  47.58 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.46 
 
 
921 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  48.28 
 
 
286 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
284 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.63 
 
 
890 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  45.67 
 
 
282 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  50.42 
 
 
370 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 
299 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  48.74 
 
 
294 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  47.2 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
1669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
371 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  44.88 
 
 
283 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 
291 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  22.32 
 
 
1041 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  50.39 
 
 
377 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.02 
 
 
900 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  48.03 
 
 
286 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 
286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.82 
 
 
951 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.47 
 
 
1114 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 
288 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  46.46 
 
 
287 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 
568 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  45.52 
 
 
422 aa  114  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 
1016 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>