More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2117 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 356 aa  725    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  31.44 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  31.94 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  31.55 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  30.52 
 
 		 479 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  29.45 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  29 
 
 		 595 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 561 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 714 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  31.16 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  29.66 
 
 		 477 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.06 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.44 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  29.19 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  32.27 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  28.15 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 492 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 		 460 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.06 
 
 		 482 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  27.67 
 
 		 466 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.53 
 
 		 484 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.37 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  29.61 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  33.87 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.31 
 
 		 480 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  28.32 
 
 		 482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  26.71 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  28.25 
 
 		 526 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  32.53 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  29 
 
 		 480 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  30.7 
 
 		 496 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  29.48 
 
 		 493 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  27.37 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  31.97 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  33.07 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  31.97 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  27.6 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  28.18 
 
 		 479 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  27.16 
 
 		 416 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  29.52 
 
 		 473 aa  109  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 487 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  27.46 
 
 		 486 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  30.41 
 
 		 622 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  31.73 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  26.19 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  28.36 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  25.77 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  28.7 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  29.46 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  31.56 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  32.27 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  27.51 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  26.81 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  28.68 
 
 		 487 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  28.78 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  27.21 
 
 		 711 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  28.61 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  28.45 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  33.85 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  27.66 
 
 		 652 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  27.6 
 
 		 633 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  28.36 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  31.42 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  36 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  27.55 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  33.84 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  27.01 
 
 		 504 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  26.96 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  29.14 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  26.69 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  29.68 
 
 		 530 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  29.14 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 539 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  26.19 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  26.29 
 
 		 478 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  26.69 
 
 		 475 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  29.5 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  33.73 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  27.69 
 
 		 463 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  34.65 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 		 501 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 		 656 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  26.93 
 
 		 657 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  32.09 
 
 		 443 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>