139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1205 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1205  peptidase M61 domain protein  100 
 
 		 606 aa  1266    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.440173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  29.7 
 
 		 594 aa  220  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  30.25 
 
 		 594 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  29.12 
 
 		 600 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  29.3 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  29.3 
 
 		 601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  29.36 
 
 		 590 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  27.35 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  26.92 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  27.1 
 
 		 599 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  27.04 
 
 		 599 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  26.54 
 
 		 599 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  26.54 
 
 		 599 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  26.49 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  26.7 
 
 		 599 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  26.78 
 
 		 622 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  28.52 
 
 		 618 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  27.61 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  25.73 
 
 		 615 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  27.77 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  28.32 
 
 		 585 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  25.89 
 
 		 596 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  27.08 
 
 		 591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  25.57 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  30.13 
 
 		 571 aa  174  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  24.19 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  25.68 
 
 		 597 aa  173  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  24.35 
 
 		 612 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  27.63 
 
 		 584 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  28.87 
 
 		 584 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  24.83 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  25.41 
 
 		 610 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  25.67 
 
 		 601 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  25 
 
 		 612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  28.38 
 
 		 585 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  28.17 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  29.36 
 
 		 497 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  26.81 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  30.26 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  25.55 
 
 		 600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  26.02 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  30.15 
 
 		 585 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  26.43 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  27.02 
 
 		 602 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  30.54 
 
 		 597 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  25.96 
 
 		 623 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  26.23 
 
 		 588 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  26.23 
 
 		 588 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  26.21 
 
 		 601 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  25.04 
 
 		 598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  26.51 
 
 		 587 aa  157  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  29.9 
 
 		 641 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  26.27 
 
 		 588 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  30.68 
 
 		 593 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  25.86 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  29.21 
 
 		 600 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  30.55 
 
 		 593 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  25.57 
 
 		 604 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  26.06 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  24.39 
 
 		 603 aa  154  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  27.61 
 
 		 613 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  24.23 
 
 		 608 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  23.87 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  26.27 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  25.65 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  23.79 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  25.32 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  29.75 
 
 		 593 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  25.47 
 
 		 588 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  24.19 
 
 		 624 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  25.65 
 
 		 588 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  27.69 
 
 		 594 aa  150  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  25.2 
 
 		 623 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  27.92 
 
 		 578 aa  150  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  28.8 
 
 		 608 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  24.32 
 
 		 605 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  28.34 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  24.6 
 
 		 605 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  24.32 
 
 		 605 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  24.32 
 
 		 605 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  24.68 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  26.12 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  24.12 
 
 		 603 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  24.96 
 
 		 588 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  26.42 
 
 		 617 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  26.42 
 
 		 607 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  24.36 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  24.4 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  24.34 
 
 		 616 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  27.47 
 
 		 618 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  23.4 
 
 		 616 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  23.51 
 
 		 631 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  20.68 
 
 		 565 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  21.72 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  24.32 
 
 		 661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>