125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1493 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  100 
 
 
604 aa  1243    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  56.65 
 
 
596 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  56.32 
 
 
597 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  56.98 
 
 
596 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  55.87 
 
 
615 aa  658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  54.29 
 
 
612 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  54.04 
 
 
599 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  53.22 
 
 
623 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  55.02 
 
 
599 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  53.87 
 
 
622 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  55.02 
 
 
599 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  55.46 
 
 
609 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  55.1 
 
 
599 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  55.29 
 
 
609 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  55.18 
 
 
612 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  55.29 
 
 
609 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  55.29 
 
 
609 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  55.8 
 
 
609 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  55.29 
 
 
609 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  54.62 
 
 
600 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  52.89 
 
 
623 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  52.66 
 
 
604 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  52.26 
 
 
587 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  54.98 
 
 
599 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  55.57 
 
 
590 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  52.57 
 
 
621 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  50.34 
 
 
585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  49.92 
 
 
591 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  48.9 
 
 
588 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  49.17 
 
 
588 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  49.25 
 
 
588 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  48.67 
 
 
588 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  48.92 
 
 
588 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  48.92 
 
 
592 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  48.9 
 
 
588 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  48.4 
 
 
588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  48.57 
 
 
588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  47.95 
 
 
601 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  47.17 
 
 
584 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  42.81 
 
 
616 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  45.55 
 
 
617 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  45.55 
 
 
607 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  48.61 
 
 
571 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  44.61 
 
 
602 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  44.65 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  45.35 
 
 
593 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  44.85 
 
 
593 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  46.53 
 
 
592 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  40.29 
 
 
602 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  47.3 
 
 
641 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  47.52 
 
 
618 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  43.84 
 
 
613 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  46.83 
 
 
597 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  42.88 
 
 
593 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  45.62 
 
 
600 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  44.35 
 
 
608 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  45.66 
 
 
578 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  41.5 
 
 
601 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  40.49 
 
 
600 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  42.45 
 
 
584 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  42.45 
 
 
584 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  36.07 
 
 
594 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  42.88 
 
 
585 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  36.97 
 
 
594 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  37.46 
 
 
585 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  42.19 
 
 
585 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  39.17 
 
 
585 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  34.82 
 
 
601 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  34.82 
 
 
601 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  37.35 
 
 
587 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  34.48 
 
 
600 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  36.33 
 
 
591 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  38.1 
 
 
631 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  35.14 
 
 
590 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  35.41 
 
 
661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  34.48 
 
 
618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  35.57 
 
 
648 aa  317  6e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  32.22 
 
 
596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  36.98 
 
 
689 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  28.76 
 
 
605 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  28.6 
 
 
605 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  28.76 
 
 
605 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  28.6 
 
 
605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  28.5 
 
 
608 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  34.26 
 
 
497 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  29.42 
 
 
601 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  32.36 
 
 
545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  28.4 
 
 
603 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  27.97 
 
 
603 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  28.14 
 
 
603 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  27.3 
 
 
603 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  28.48 
 
 
598 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  27.59 
 
 
624 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  26.47 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  30.41 
 
 
565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  28.14 
 
 
601 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  26.43 
 
 
616 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  27.18 
 
 
598 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  31.99 
 
 
528 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  30.05 
 
 
565 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>