125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1530 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  65.46 
 
 
608 aa  753    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  65.45 
 
 
613 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  69.8 
 
 
597 aa  797    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  64.03 
 
 
600 aa  738    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  68.57 
 
 
593 aa  804    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  61.46 
 
 
592 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  59.61 
 
 
571 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 
641 aa  1307    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  69.74 
 
 
593 aa  802    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  61.09 
 
 
578 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  63.9 
 
 
618 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  49.72 
 
 
600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  49.26 
 
 
622 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  49.53 
 
 
596 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  49.06 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  49.06 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  48.87 
 
 
599 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  49.53 
 
 
597 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  48.5 
 
 
599 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  48.87 
 
 
599 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  48.96 
 
 
596 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  48.49 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  48.41 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  48.49 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  48.49 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  48.67 
 
 
609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  48.67 
 
 
609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  48.49 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  44.5 
 
 
612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  47.92 
 
 
615 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  46.22 
 
 
604 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  45.39 
 
 
623 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  45.39 
 
 
623 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  46.33 
 
 
621 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  47.11 
 
 
604 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  48.18 
 
 
590 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  44.47 
 
 
587 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  43.8 
 
 
592 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  45.54 
 
 
584 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  41.82 
 
 
591 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  41.24 
 
 
585 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  42.48 
 
 
588 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  41.67 
 
 
601 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  42.67 
 
 
588 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  42.29 
 
 
588 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  42.29 
 
 
588 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  41.73 
 
 
588 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  43.15 
 
 
594 aa  398  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  42.29 
 
 
588 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  41.95 
 
 
588 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  41.92 
 
 
588 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  41.86 
 
 
602 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  39.85 
 
 
593 aa  356  8.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  36.73 
 
 
594 aa  339  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  38.4 
 
 
661 aa  330  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  38.39 
 
 
587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  37.02 
 
 
601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  39.38 
 
 
617 aa  325  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  39.85 
 
 
585 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  36.14 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  39.59 
 
 
607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  38.75 
 
 
591 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  41.17 
 
 
584 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  38.57 
 
 
585 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  37.64 
 
 
631 aa  316  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  36.93 
 
 
600 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  40.98 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  35.3 
 
 
602 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  38.15 
 
 
648 aa  310  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  39.47 
 
 
585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  34.35 
 
 
616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  40.53 
 
 
585 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  33.63 
 
 
596 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  32.65 
 
 
601 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  32.65 
 
 
601 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  32.9 
 
 
600 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  34.92 
 
 
590 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  38.69 
 
 
689 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  31.34 
 
 
618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  34.62 
 
 
545 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  33.33 
 
 
565 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  32.31 
 
 
565 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  32.95 
 
 
528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  28.74 
 
 
603 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  28.74 
 
 
603 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  28.98 
 
 
603 aa  210  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  29.29 
 
 
605 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  27.79 
 
 
605 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  29 
 
 
608 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  27.8 
 
 
616 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  29.85 
 
 
598 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  28.92 
 
 
605 aa  203  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  29.34 
 
 
601 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  27.52 
 
 
605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  29.36 
 
 
598 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  29.8 
 
 
624 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  28.62 
 
 
603 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  30.29 
 
 
497 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  26.25 
 
 
610 aa  190  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  27.59 
 
 
601 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>