130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2315 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2724  protease, putative  92.69 
 
 		 588 aa  1145    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  65.03 
 
 		 591 aa  817    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1231    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  99.15 
 
 		 588 aa  1219    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  66.72 
 
 		 585 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  97.28 
 
 		 588 aa  1196    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  66.5 
 
 		 587 aa  816    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  86.22 
 
 		 588 aa  1071    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  86.71 
 
 		 592 aa  1069    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  86.56 
 
 		 588 aa  1077    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  86.39 
 
 		 588 aa  1071    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  86.22 
 
 		 588 aa  1075    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  48.9 
 
 		 604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  49.92 
 
 		 604 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  48.86 
 
 		 612 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  48.11 
 
 		 615 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  47.55 
 
 		 597 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  46.83 
 
 		 623 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  46.5 
 
 		 623 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  47.72 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  47.72 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  46.66 
 
 		 621 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  48.43 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  48.26 
 
 		 599 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  47.91 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  47.91 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  47.91 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  47.74 
 
 		 612 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  47.91 
 
 		 599 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  47.91 
 
 		 622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  47.04 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  44.85 
 
 		 601 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  46.44 
 
 		 590 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  40.79 
 
 		 616 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  39.87 
 
 		 602 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  42.24 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  41.9 
 
 		 593 aa  422  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  41.25 
 
 		 592 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  43.53 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  41.74 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  43.15 
 
 		 618 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  41.86 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  39.77 
 
 		 600 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  44.69 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  40.44 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  40.46 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  42.29 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  42.8 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  39.86 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  39.86 
 
 		 607 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  36.88 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  36.51 
 
 		 593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  36.05 
 
 		 600 aa  351  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  33.39 
 
 		 594 aa  346  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  37.62 
 
 		 584 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  36.03 
 
 		 601 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  36.82 
 
 		 584 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  37.56 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  33.44 
 
 		 594 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  34.6 
 
 		 661 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  34.29 
 
 		 631 aa  332  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  35.93 
 
 		 585 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  36.13 
 
 		 648 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  36.84 
 
 		 585 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  34.27 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  34.27 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  34.44 
 
 		 590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  31.24 
 
 		 600 aa  320  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  33.84 
 
 		 591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  32.05 
 
 		 585 aa  309  9e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  32.61 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  35.64 
 
 		 689 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  31.78 
 
 		 596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  30.58 
 
 		 618 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  28.11 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  28.69 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  29.58 
 
 		 598 aa  236  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  28.05 
 
 		 624 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  28.45 
 
 		 616 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  27.97 
 
 		 603 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  27.3 
 
 		 605 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  27.64 
 
 		 603 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  27.3 
 
 		 605 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  30.84 
 
 		 545 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  28.19 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  27.14 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  28.45 
 
 		 603 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  31.05 
 
 		 565 aa  211  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  27.21 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  27.3 
 
 		 598 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  26.47 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  27.23 
 
 		 601 aa  200  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  27.43 
 
 		 565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  28.81 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  27.7 
 
 		 497 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>