151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3082 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1234    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  83.97 
 
 		 601 aa  1040    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  53.52 
 
 		 585 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  46.62 
 
 		 585 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  44.09 
 
 		 594 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  41.9 
 
 		 594 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  39.64 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  43.43 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  40.84 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  40.84 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  41.11 
 
 		 590 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  42.04 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  44.7 
 
 		 585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  43.68 
 
 		 584 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  43.51 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  44.32 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  36.62 
 
 		 596 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  36.75 
 
 		 618 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  41.14 
 
 		 615 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  39.77 
 
 		 604 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  38.82 
 
 		 612 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  38.76 
 
 		 604 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  32.94 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  39.08 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  39.21 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  39.21 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  39.04 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  39.12 
 
 		 590 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  39.04 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  39.04 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  39.04 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  38.57 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  38.6 
 
 		 599 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  38.74 
 
 		 596 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  38.33 
 
 		 621 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  38.44 
 
 		 599 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  38.44 
 
 		 599 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  37.34 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  36.6 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  37.62 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  36.48 
 
 		 587 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  37.99 
 
 		 597 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  37.13 
 
 		 622 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  38.01 
 
 		 600 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  37.91 
 
 		 599 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  35.93 
 
 		 588 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  36.05 
 
 		 588 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  34.8 
 
 		 592 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  34.93 
 
 		 585 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  37.34 
 
 		 584 aa  352  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  36.05 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  35.82 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  39.86 
 
 		 689 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  34.93 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  34.12 
 
 		 591 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  38.22 
 
 		 571 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  35.36 
 
 		 588 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  35.36 
 
 		 588 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  37.18 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  34.87 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  32.38 
 
 		 608 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  36.5 
 
 		 593 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  38.94 
 
 		 578 aa  336  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  37.31 
 
 		 613 aa  336  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  37.02 
 
 		 592 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  34.74 
 
 		 601 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  36.58 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  30.92 
 
 		 605 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  30.92 
 
 		 605 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  30.92 
 
 		 605 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  36.23 
 
 		 600 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  30.92 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  35.45 
 
 		 618 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  32.38 
 
 		 624 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  36.93 
 
 		 641 aa  316  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  30.86 
 
 		 616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  31.53 
 
 		 603 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  31.83 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  31.37 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  31.2 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  31.77 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  31.27 
 
 		 601 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  33.88 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  32.99 
 
 		 602 aa  303  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  31.03 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  34.8 
 
 		 602 aa  286  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  29.39 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  31.44 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  35.35 
 
 		 607 aa  276  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  35.35 
 
 		 617 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  31.87 
 
 		 661 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  33.46 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  31.99 
 
 		 631 aa  273  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  31.95 
 
 		 648 aa  270  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  31.29 
 
 		 594 aa  269  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  34.16 
 
 		 497 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  29.3 
 
 		 565 aa  236  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  33.56 
 
 		 528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  29.1 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  29.9 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>