185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3680 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3680  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 211 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1289  16S rRNA processing protein RimM  39.81 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1664  16S rRNA processing protein RimM  39.81 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0329621  hitchhiker  0.00376352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0967  16S rRNA processing protein RimM  35 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000740944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2005  16S rRNA processing protein RimM  35 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000559239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  27.85 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1964  16S rRNA-processing protein RimM  28.66 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  29.3 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  27.49 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  29.38 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  29.78 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  26.67 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  28.03 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  27.67 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  30.34 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  37 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  34.13 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  30.72 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  34.13 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  36 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  30.65 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  26.04 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  33.95 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  24.71 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  26.94 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  38.1 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  22.01 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  26.63 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  30.3 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3758  16S rRNA processing protein RimM  27.22 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0504856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  25.15 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  23.53 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  24.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  35.4 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  33.54 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  23.21 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3366  16S rRNA processing protein RimM  35.35 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83337 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1535  16S rRNA processing protein RimM  26.58 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00265207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  29.81 
 
 		 169 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  26.62 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  23.95 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  32.17 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  36.19 
 
 		 173 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  24.19 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  29.84 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  27.33 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  24 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  36.45 
 
 		 173 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  31.18 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  36.45 
 
 		 173 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  36.45 
 
 		 173 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  27.74 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  27.27 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  27.16 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  28.03 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  28.12 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  22.62 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  24.28 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  21.88 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  27.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  31.52 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  26.09 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1169  16S rRNA processing protein RimM  35.09 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  24.54 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  33 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  31.14 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  27.85 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  25.73 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  34 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1472  16S rRNA processing protein RimM  33.54 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.65 
 
 		 347 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  32.93 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  30.39 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  29.13 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1016  16S rRNA processing protein RimM  28.66 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000810353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0805  16S rRNA-processing protein RimM  35.42 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  33.14 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2485  16S rRNA processing protein RimM  31.29 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423168  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  25.93 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  33 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  24.76 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0074  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0088  16S rRNA-processing protein RimM  32.71 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  26.97 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  32.73 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3015  16S rRNA-processing protein RimM  30.51 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00120588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  26.52 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  25.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  25.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2307  16S rRNA processing protein RimM  25.15 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00013128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  29.13 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>