More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1531 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
408 aa  821    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.48 
 
 
408 aa  484  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.18 
 
 
411 aa  481  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.91 
 
 
411 aa  477  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.42 
 
 
411 aa  474  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.52 
 
 
423 aa  393  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  47.03 
 
 
415 aa  375  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.34 
 
 
415 aa  359  5e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.58 
 
 
408 aa  358  7e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.5 
 
 
411 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.77 
 
 
412 aa  346  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.22 
 
 
426 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.02 
 
 
403 aa  341  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.05 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.48 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.8 
 
 
410 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  43.66 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.54 
 
 
410 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.29 
 
 
410 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.53 
 
 
410 aa  335  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.22 
 
 
409 aa  333  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.71 
 
 
409 aa  333  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.55 
 
 
411 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44 
 
 
408 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.28 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.56 
 
 
420 aa  326  6e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.79 
 
 
411 aa  325  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  40.38 
 
 
514 aa  305  8.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.09 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  38.11 
 
 
463 aa  302  8.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  40.62 
 
 
522 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  41.81 
 
 
453 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  39.72 
 
 
473 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.05 
 
 
636 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.44 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.29 
 
 
644 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.29 
 
 
650 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.6 
 
 
642 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.01 
 
 
636 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.78 
 
 
619 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.58 
 
 
657 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.52 
 
 
642 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.01 
 
 
643 aa  116  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  28.37 
 
 
657 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.82 
 
 
641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.43 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.3 
 
 
628 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.73 
 
 
636 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.27 
 
 
634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 
636 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.79 
 
 
636 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.04 
 
 
635 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.5 
 
 
635 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.86 
 
 
635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.8 
 
 
635 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.68 
 
 
644 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.86 
 
 
633 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.68 
 
 
637 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 
636 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.91 
 
 
629 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.56 
 
 
635 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.8 
 
 
636 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.32 
 
 
634 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  26.92 
 
 
621 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  26.98 
 
 
396 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.98 
 
 
612 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.22 
 
 
601 aa  103  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.74 
 
 
565 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.74 
 
 
565 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.79 
 
 
615 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.74 
 
 
570 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  26.69 
 
 
396 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.17 
 
 
637 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.8 
 
 
637 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  27.49 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  27.54 
 
 
396 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  26.32 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.56 
 
 
649 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.25 
 
 
597 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  27.27 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.44 
 
 
594 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.97 
 
 
631 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.19 
 
 
614 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  26.62 
 
 
614 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  30.19 
 
 
614 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.19 
 
 
614 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.83 
 
 
635 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.17 
 
 
636 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.52 
 
 
605 aa  97.1  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  25.73 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  29.34 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.61 
 
 
627 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.87 
 
 
605 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.87 
 
 
614 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.696319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.37 
 
 
614 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  26.37 
 
 
614 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  27.3 
 
 
401 aa  96.3  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  27.41 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.47 
 
 
591 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.55 
 
 
604 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>