More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3580 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 597 aa  1145    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  65.33 
 
 		 603 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  58.33 
 
 		 594 aa  586  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.39 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  49.83 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04260  selenocysteine-specific translation elongation factor  49.84 
 
 		 630 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.974892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.57 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.56 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.23 
 
 		 580 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.83 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.53 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.53 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.96 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.4 
 
 		 592 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.75 
 
 		 634 aa  260  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.9 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.27 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.91 
 
 		 631 aa  244  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.07 
 
 		 635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.95 
 
 		 635 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.68 
 
 		 636 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.8 
 
 		 635 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.25 
 
 		 655 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.38 
 
 		 628 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.66 
 
 		 636 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.76 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  41.39 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.35 
 
 		 636 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.56 
 
 		 644 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.01 
 
 		 627 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.3 
 
 		 634 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  31.58 
 
 		 657 aa  220  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  33.7 
 
 		 641 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.44 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.42 
 
 		 637 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  39.73 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.19 
 
 		 644 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.67 
 
 		 640 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.86 
 
 		 634 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.15 
 
 		 650 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.83 
 
 		 616 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.59 
 
 		 616 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.38 
 
 		 640 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.67 
 
 		 616 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.18 
 
 		 657 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.72 
 
 		 636 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.41 
 
 		 616 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.63 
 
 		 636 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.62 
 
 		 642 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.77 
 
 		 634 aa  209  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.56 
 
 		 640 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.48 
 
 		 615 aa  208  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.26 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  37.95 
 
 		 641 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.37 
 
 		 643 aa  207  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.26 
 
 		 614 aa  206  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.18 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.42 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  30.18 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.26 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.43 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.26 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.65 
 
 		 643 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  37.5 
 
 		 621 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.9 
 
 		 614 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.12 
 
 		 629 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.04 
 
 		 612 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.41 
 
 		 614 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.03 
 
 		 643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.52 
 
 		 649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.05 
 
 		 649 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.63 
 
 		 642 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  40.16 
 
 		 649 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.79 
 
 		 649 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.68 
 
 		 635 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.69 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.11 
 
 		 635 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.4 
 
 		 641 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.2 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.14 
 
 		 637 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.7 
 
 		 636 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.92 
 
 		 691 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.73 
 
 		 641 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.1 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.1 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.1 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.47 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.17 
 
 		 590 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.47 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.47 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.47 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.47 
 
 		 651 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.4 
 
 		 641 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.4 
 
 		 641 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.19 
 
 		 641 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.62 
 
 		 681 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.31 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.2 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.66 
 
 		 643 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>