More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5282 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 603 aa  1132    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  65.33 
 
 		 597 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  61.54 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  49.07 
 
 		 604 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.83 
 
 		 596 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  51.26 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04260  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.71 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.974892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.41 
 
 		 591 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.72 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.87 
 
 		 570 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  49.25 
 
 		 592 aa  360  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.87 
 
 		 565 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  45.87 
 
 		 565 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  48.39 
 
 		 586 aa  359  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.47 
 
 		 634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  44.17 
 
 		 627 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.54 
 
 		 635 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.32 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.39 
 
 		 644 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.12 
 
 		 634 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.85 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.96 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.1 
 
 		 644 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.14 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.5 
 
 		 636 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.81 
 
 		 628 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.7 
 
 		 635 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.4 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.37 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.77 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.16 
 
 		 634 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.96 
 
 		 627 aa  217  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.59 
 
 		 636 aa  217  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 629 aa  217  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.65 
 
 		 655 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  32.51 
 
 		 641 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.44 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.6 
 
 		 642 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.44 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  32.51 
 
 		 641 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.21 
 
 		 635 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.79 
 
 		 636 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.04 
 
 		 614 aa  210  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.37 
 
 		 635 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.76 
 
 		 636 aa  210  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.39 
 
 		 637 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.04 
 
 		 614 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.95 
 
 		 649 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.26 
 
 		 636 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.79 
 
 		 649 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.04 
 
 		 614 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.04 
 
 		 614 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.04 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.27 
 
 		 621 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  31.04 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.11 
 
 		 640 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.74 
 
 		 649 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.81 
 
 		 643 aa  207  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.79 
 
 		 649 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.86 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.88 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.39 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.7 
 
 		 640 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.72 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.08 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.01 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.88 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  40.16 
 
 		 636 aa  203  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  40 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 		 640 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.18 
 
 		 650 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.3 
 
 		 648 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.83 
 
 		 616 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.93 
 
 		 643 aa  191  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.57 
 
 		 616 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  32.27 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.57 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.57 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  35.99 
 
 		 616 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.72 
 
 		 590 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.7 
 
 		 673 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.98 
 
 		 637 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.41 
 
 		 681 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.07 
 
 		 681 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.84 
 
 		 673 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.84 
 
 		 673 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.16 
 
 		 637 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.59 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.14 
 
 		 641 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.18 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.16 
 
 		 681 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.35 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.35 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.35 
 
 		 641 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.82 
 
 		 673 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4114  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.96 
 
 		 657 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.15 
 
 		 643 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0043  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.13 
 
 		 657 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.6 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  24.75 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>