More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1287 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  63.5 
 
 
601 aa  758    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  100 
 
 
601 aa  1204    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  63.33 
 
 
601 aa  754    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  63.5 
 
 
601 aa  758    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.08 
 
 
605 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  48.56 
 
 
606 aa  553  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.19 
 
 
605 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.04 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  42.86 
 
 
611 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  42.18 
 
 
611 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  26.38 
 
 
657 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.57 
 
 
636 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.51 
 
 
642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.44 
 
 
634 aa  197  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.71 
 
 
635 aa  194  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.03 
 
 
633 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.15 
 
 
636 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.31 
 
 
644 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.74 
 
 
628 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.77 
 
 
637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.15 
 
 
636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.83 
 
 
649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.72 
 
 
641 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.08 
 
 
641 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.03 
 
 
634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.45 
 
 
636 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.44 
 
 
636 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.07 
 
 
629 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.52 
 
 
641 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.15 
 
 
650 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.07 
 
 
619 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.46 
 
 
627 aa  180  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.08 
 
 
649 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.08 
 
 
649 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.91 
 
 
649 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.39 
 
 
642 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.25 
 
 
634 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.65 
 
 
636 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.25 
 
 
634 aa  176  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.08 
 
 
643 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.63 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.65 
 
 
636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.81 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.79 
 
 
644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.63 
 
 
631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.65 
 
 
635 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  23.42 
 
 
641 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.22 
 
 
648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2923  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.01 
 
 
650 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.85 
 
 
612 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.43 
 
 
641 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.43 
 
 
641 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.43 
 
 
641 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.2 
 
 
655 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.81 
 
 
641 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.12 
 
 
643 aa  170  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  23.59 
 
 
641 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  24.88 
 
 
637 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.54 
 
 
597 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.46 
 
 
643 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.92 
 
 
641 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.92 
 
 
637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.38 
 
 
604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.85 
 
 
646 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3075  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.85 
 
 
657 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.85 
 
 
640 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.48 
 
 
591 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.27 
 
 
640 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.16 
 
 
641 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.75 
 
 
603 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.16 
 
 
651 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.16 
 
 
641 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.03 
 
 
640 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.16 
 
 
651 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.16 
 
 
651 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.16 
 
 
651 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.16 
 
 
651 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.37 
 
 
627 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.01 
 
 
621 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.42 
 
 
616 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.15 
 
 
616 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.2 
 
 
640 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.96 
 
 
681 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.15 
 
 
616 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.5 
 
 
596 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  26.87 
 
 
616 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.15 
 
 
616 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.5 
 
 
641 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.99 
 
 
570 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.25 
 
 
592 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.06 
 
 
614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.06 
 
 
614 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.7 
 
 
565 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.7 
 
 
565 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.09 
 
 
586 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.78 
 
 
614 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.4 
 
 
673 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.22 
 
 
614 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.22 
 
 
657 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.78 
 
 
614 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>