More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3739 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 591 aa  1105    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  59.97 
 
 		 580 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  53.06 
 
 		 596 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  52.33 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  56.06 
 
 		 570 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  56.57 
 
 		 592 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  55.71 
 
 		 565 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  55.71 
 
 		 565 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  53.38 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  55.31 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  51.33 
 
 		 594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  48.26 
 
 		 597 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.75 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04260  selenocysteine-specific translation elongation factor  49.29 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.974892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.71 
 
 		 619 aa  259  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.13 
 
 		 627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.71 
 
 		 636 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.22 
 
 		 634 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.09 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.74 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.05 
 
 		 636 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.46 
 
 		 655 aa  230  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.63 
 
 		 642 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.67 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.69 
 
 		 635 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  31.48 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.13 
 
 		 635 aa  223  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.82 
 
 		 634 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.99 
 
 		 636 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.21 
 
 		 633 aa  219  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.95 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.83 
 
 		 643 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.82 
 
 		 644 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.57 
 
 		 631 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.65 
 
 		 642 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.06 
 
 		 635 aa  217  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.28 
 
 		 636 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.1 
 
 		 657 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.98 
 
 		 635 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  34.53 
 
 		 641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.83 
 
 		 635 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.72 
 
 		 637 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  34.59 
 
 		 641 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.6 
 
 		 650 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.25 
 
 		 644 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.07 
 
 		 635 aa  210  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  39 
 
 		 643 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.59 
 
 		 616 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.59 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.33 
 
 		 616 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.33 
 
 		 616 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  39.07 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.89 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.4 
 
 		 673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  44.11 
 
 		 681 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.9 
 
 		 627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.07 
 
 		 629 aa  198  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.16 
 
 		 681 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.22 
 
 		 673 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  36.68 
 
 		 641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.73 
 
 		 681 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.73 
 
 		 615 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.99 
 
 		 614 aa  196  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.24 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  37.24 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.82 
 
 		 606 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  37.24 
 
 		 614 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  37.24 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  37.24 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.92 
 
 		 634 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.73 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.86 
 
 		 643 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.99 
 
 		 614 aa  193  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.48 
 
 		 673 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  36.73 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30 
 
 		 673 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.25 
 
 		 612 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.02 
 
 		 621 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.15 
 
 		 649 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.28 
 
 		 648 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.14 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.2 
 
 		 649 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  36 
 
 		 649 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.38 
 
 		 640 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.78 
 
 		 637 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.12 
 
 		 637 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.78 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.74 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.23 
 
 		 641 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.51 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.83 
 
 		 641 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.49 
 
 		 641 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.49 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.49 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.49 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.49 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.49 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>