More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0756 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  70.74 
 
 		 605 aa  882    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 606 aa  1211    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  52.89 
 
 		 605 aa  648    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  54.56 
 
 		 601 aa  633  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  52.98 
 
 		 601 aa  628  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  53.15 
 
 		 601 aa  628  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  52.15 
 
 		 601 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.61 
 
 		 611 aa  561  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  48.56 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  45.72 
 
 		 611 aa  531  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.94 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.5 
 
 		 634 aa  267  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.37 
 
 		 657 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.15 
 
 		 636 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.76 
 
 		 619 aa  253  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.2 
 
 		 642 aa  250  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.99 
 
 		 644 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  29.15 
 
 		 641 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.54 
 
 		 629 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.6 
 
 		 634 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.44 
 
 		 637 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.74 
 
 		 636 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  29.28 
 
 		 641 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.58 
 
 		 636 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.49 
 
 		 612 aa  241  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.04 
 
 		 636 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.35 
 
 		 636 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.58 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.06 
 
 		 643 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.89 
 
 		 649 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.74 
 
 		 649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  28.48 
 
 		 641 aa  236  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.46 
 
 		 635 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.58 
 
 		 641 aa  233  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  38.42 
 
 		 657 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.35 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37.37 
 
 		 627 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.94 
 
 		 641 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.7 
 
 		 650 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.52 
 
 		 634 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.99 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.57 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.38 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.38 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.5 
 
 		 635 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.38 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  45.17 
 
 		 648 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.87 
 
 		 634 aa  226  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.02 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.39 
 
 		 644 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.82 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.3 
 
 		 641 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.82 
 
 		 651 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.82 
 
 		 651 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.82 
 
 		 651 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.82 
 
 		 651 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.3 
 
 		 641 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.82 
 
 		 641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.82 
 
 		 641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.03 
 
 		 635 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.53 
 
 		 628 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.74 
 
 		 649 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.96 
 
 		 636 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.64 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.84 
 
 		 637 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.68 
 
 		 646 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.08 
 
 		 631 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.93 
 
 		 633 aa  216  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.59 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.61 
 
 		 655 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.45 
 
 		 637 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.43 
 
 		 614 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.42 
 
 		 614 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.59 
 
 		 615 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.15 
 
 		 614 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.88 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.15 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.88 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  34.15 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.88 
 
 		 614 aa  207  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.91 
 
 		 590 aa  206  7e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.15 
 
 		 614 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.54 
 
 		 640 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  35.21 
 
 		 621 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.32 
 
 		 565 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.32 
 
 		 565 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.32 
 
 		 570 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.92 
 
 		 616 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.28 
 
 		 640 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.51 
 
 		 635 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.54 
 
 		 640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2923  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.17 
 
 		 650 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.67 
 
 		 616 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.28 
 
 		 640 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.67 
 
 		 616 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.68 
 
 		 643 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.67 
 
 		 616 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.92 
 
 		 616 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.24 
 
 		 605 aa  199  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.47 
 
 		 673 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>