More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5304 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  98.94 
 
 		 570 aa  1066    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  100 
 
 		 565 aa  1078    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  100 
 
 		 565 aa  1078    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  58.12 
 
 		 583 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.51 
 
 		 604 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  53.98 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  55.22 
 
 		 592 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  49.58 
 
 		 596 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.6 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  45.53 
 
 		 597 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  47.19 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  50.51 
 
 		 586 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  45.8 
 
 		 603 aa  347  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04260  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.08 
 
 		 630 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.974892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.78 
 
 		 619 aa  277  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.19 
 
 		 627 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.04 
 
 		 629 aa  226  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.32 
 
 		 636 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  42.74 
 
 		 636 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 		 635 aa  217  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.88 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.53 
 
 		 636 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.74 
 
 		 628 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.32 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  42.22 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.44 
 
 		 644 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 		 635 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.18 
 
 		 655 aa  203  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.45 
 
 		 633 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.16 
 
 		 634 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.84 
 
 		 634 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.67 
 
 		 636 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.75 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.76 
 
 		 635 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  37.82 
 
 		 657 aa  196  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  32.54 
 
 		 641 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.44 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  46.4 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.17 
 
 		 642 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.47 
 
 		 650 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.08 
 
 		 637 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.57 
 
 		 635 aa  193  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.67 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.41 
 
 		 631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.75 
 
 		 681 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.44 
 
 		 636 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.04 
 
 		 673 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.9 
 
 		 681 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.9 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.97 
 
 		 681 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.88 
 
 		 673 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.78 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  44.92 
 
 		 657 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  37.82 
 
 		 641 aa  187  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.13 
 
 		 615 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  31.58 
 
 		 641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.45 
 
 		 673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.08 
 
 		 635 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.19 
 
 		 673 aa  183  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.48 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.6 
 
 		 614 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  42.58 
 
 		 644 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.4 
 
 		 616 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.91 
 
 		 635 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.75 
 
 		 643 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.63 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.29 
 
 		 616 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.27 
 
 		 614 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.27 
 
 		 614 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  31.27 
 
 		 614 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.23 
 
 		 616 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.38 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.38 
 
 		 614 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.53 
 
 		 616 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.53 
 
 		 616 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.49 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.57 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  38.1 
 
 		 614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.66 
 
 		 611 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.81 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.96 
 
 		 627 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.51 
 
 		 640 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.28 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.07 
 
 		 649 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.9 
 
 		 640 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.55 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.39 
 
 		 649 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.5 
 
 		 640 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  22.24 
 
 		 601 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.8 
 
 		 640 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.31 
 
 		 605 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.44 
 
 		 601 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  22.24 
 
 		 601 aa  164  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  23.06 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.91 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.91 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.91 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.92 
 
 		 643 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.3 
 
 		 646 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  26.06 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>