More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  100 
 
 		 594 aa  1129    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  58.33 
 
 		 597 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5282  selenocysteine-specific translation elongation factor  61.54 
 
 		 603 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04260  selenocysteine-specific translation elongation factor  52.85 
 
 		 630 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.974892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  48.41 
 
 		 604 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  49.92 
 
 		 583 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  51.33 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.06 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.63 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  46.92 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  46.92 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  48.83 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  46.58 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1609  selenocysteine-specific translation elongation factor  49 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.86 
 
 		 635 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.74 
 
 		 634 aa  262  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.96 
 
 		 619 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.85 
 
 		 627 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.91 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.67 
 
 		 636 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.24 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.3 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.32 
 
 		 635 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.27 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.14 
 
 		 644 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.23 
 
 		 636 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.49 
 
 		 636 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.8 
 
 		 643 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.99 
 
 		 635 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.77 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.38 
 
 		 629 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.69 
 
 		 644 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.48 
 
 		 628 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.08 
 
 		 636 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.98 
 
 		 635 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.27 
 
 		 621 aa  223  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.17 
 
 		 649 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.14 
 
 		 635 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.09 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.8 
 
 		 633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.29 
 
 		 614 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.48 
 
 		 614 aa  220  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.52 
 
 		 614 aa  220  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.19 
 
 		 615 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.36 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.86 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  30.97 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  30.86 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.6 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.6 
 
 		 614 aa  219  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.02 
 
 		 649 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.92 
 
 		 649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.67 
 
 		 637 aa  216  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.22 
 
 		 642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.07 
 
 		 649 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.52 
 
 		 627 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.14 
 
 		 655 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.2 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.18 
 
 		 657 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.2 
 
 		 616 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.13 
 
 		 616 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.19 
 
 		 616 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  33.23 
 
 		 641 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.04 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.11 
 
 		 636 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  35.84 
 
 		 641 aa  208  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.64 
 
 		 650 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  33.54 
 
 		 641 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.39 
 
 		 681 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.67 
 
 		 643 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.28 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.6 
 
 		 681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.44 
 
 		 634 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.89 
 
 		 681 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.95 
 
 		 673 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.23 
 
 		 641 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.08 
 
 		 636 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.75 
 
 		 640 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.29 
 
 		 673 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.17 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.05 
 
 		 673 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.18 
 
 		 643 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.17 
 
 		 651 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.17 
 
 		 641 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.23 
 
 		 673 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.17 
 
 		 651 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.17 
 
 		 651 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.17 
 
 		 651 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  33.01 
 
 		 651 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.12 
 
 		 648 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.13 
 
 		 640 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.96 
 
 		 637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.45 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.39 
 
 		 640 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.84 
 
 		 691 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 646 aa  184  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.55 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.73 
 
 		 641 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.91 
 
 		 606 aa  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.61 
 
 		 590 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>