More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2923 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2923  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 650 aa  1199    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3075  selenocysteine-specific translation elongation factor  62.44 
 
 		 657 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.87 
 
 		 634 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.42 
 
 		 644 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.38 
 
 		 635 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.12 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.62 
 
 		 642 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.34 
 
 		 636 aa  349  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.28 
 
 		 636 aa  343  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.67 
 
 		 642 aa  343  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37.58 
 
 		 644 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.22 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.37 
 
 		 631 aa  339  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.43 
 
 		 634 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.81 
 
 		 633 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.81 
 
 		 635 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.97 
 
 		 636 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.15 
 
 		 635 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.05 
 
 		 619 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.52 
 
 		 636 aa  327  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.66 
 
 		 636 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.26 
 
 		 636 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.43 
 
 		 634 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.83 
 
 		 649 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.67 
 
 		 649 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  40.09 
 
 		 649 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.83 
 
 		 650 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.19 
 
 		 629 aa  299  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.93 
 
 		 635 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.62 
 
 		 635 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.85 
 
 		 649 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.55 
 
 		 634 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.78 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.74 
 
 		 628 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.98 
 
 		 648 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.93 
 
 		 641 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.26 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.26 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.26 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.12 
 
 		 657 aa  264  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.83 
 
 		 641 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.07 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.76 
 
 		 627 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.68 
 
 		 641 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.81 
 
 		 643 aa  253  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  33.08 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.38 
 
 		 641 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.22 
 
 		 641 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.21 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.21 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.21 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.21 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.22 
 
 		 641 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  37.21 
 
 		 651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.44 
 
 		 637 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.72 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.54 
 
 		 643 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.86 
 
 		 646 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.53 
 
 		 655 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  39.07 
 
 		 641 aa  227  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  35.02 
 
 		 641 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  35.4 
 
 		 641 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.67 
 
 		 636 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  26.71 
 
 		 611 aa  213  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.62 
 
 		 627 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.94 
 
 		 691 aa  210  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.36 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.08 
 
 		 605 aa  204  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  23.24 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  23.41 
 
 		 601 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.32 
 
 		 643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  41.6 
 
 		 643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  22.97 
 
 		 601 aa  197  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.53 
 
 		 640 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.01 
 
 		 640 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.74 
 
 		 611 aa  189  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.82 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.23 
 
 		 604 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.13 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  28.33 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.06 
 
 		 583 aa  178  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.61 
 
 		 681 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.71 
 
 		 681 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.02 
 
 		 673 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.39 
 
 		 673 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.72 
 
 		 601 aa  171  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.38 
 
 		 605 aa  170  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.55 
 
 		 673 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.55 
 
 		 673 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.8 
 
 		 621 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.93 
 
 		 681 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.28 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1632  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.22 
 
 		 586 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.24 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.4 
 
 		 590 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.08 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.79 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.79 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.79 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.11 
 
 		 635 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>