More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2083 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 
611 aa  1249    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  51.23 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.13 
 
 
605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.61 
 
 
606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  47.47 
 
 
601 aa  547  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.7 
 
 
605 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  43.75 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  43.75 
 
 
601 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  43.04 
 
 
601 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  42.18 
 
 
601 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.2 
 
 
636 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.23 
 
 
636 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.13 
 
 
634 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.17 
 
 
636 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.36 
 
 
635 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.78 
 
 
644 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.33 
 
 
642 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.39 
 
 
636 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.16 
 
 
629 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.02 
 
 
634 aa  250  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.88 
 
 
633 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.24 
 
 
657 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.12 
 
 
619 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.88 
 
 
628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.3 
 
 
634 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.42 
 
 
635 aa  243  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.7 
 
 
642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  39.95 
 
 
627 aa  239  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.95 
 
 
634 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.99 
 
 
644 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.26 
 
 
649 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.35 
 
 
635 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.05 
 
 
635 aa  236  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.19 
 
 
635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.41 
 
 
643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.1 
 
 
649 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.38 
 
 
636 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.01 
 
 
649 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.31 
 
 
631 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.84 
 
 
648 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.03 
 
 
636 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.1 
 
 
636 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.89 
 
 
612 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.41 
 
 
636 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.69 
 
 
650 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.93 
 
 
637 aa  220  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.89 
 
 
649 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.55 
 
 
643 aa  219  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.67 
 
 
655 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.67 
 
 
637 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.29 
 
 
641 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 
641 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  33 
 
 
641 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.53 
 
 
641 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.24 
 
 
641 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  33.08 
 
 
641 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.99 
 
 
641 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.03 
 
 
640 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.99 
 
 
641 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  33.1 
 
 
641 aa  207  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.99 
 
 
651 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.99 
 
 
651 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.99 
 
 
651 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.99 
 
 
651 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  35.99 
 
 
651 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.57 
 
 
641 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.42 
 
 
637 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.09 
 
 
640 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.25 
 
 
646 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
641 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
641 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
641 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.6 
 
 
640 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  34.09 
 
 
657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.33 
 
 
640 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.51 
 
 
614 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  33.51 
 
 
614 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.25 
 
 
614 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.38 
 
 
614 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.51 
 
 
614 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.06 
 
 
590 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.33 
 
 
614 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.72 
 
 
616 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.98 
 
 
614 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0091  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.24 
 
 
615 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.72 
 
 
614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.72 
 
 
614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.08 
 
 
643 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.37 
 
 
643 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.79 
 
 
621 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.44 
 
 
635 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3896  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.94 
 
 
616 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.94 
 
 
616 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.187255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.17 
 
 
681 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.9 
 
 
681 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4067  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.94 
 
 
616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3960  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  31.94 
 
 
616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293877  normal  0.449434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.59 
 
 
681 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.71 
 
 
627 aa  184  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.59 
 
 
673 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>