More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3075 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3075  selenocysteine-specific translation elongation factor  100 
 
 		 657 aa  1243    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2923  selenocysteine-specific translation elongation factor  62.44 
 
 		 650 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37.98 
 
 		 634 aa  363  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.69 
 
 		 619 aa  360  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.91 
 
 		 642 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.02 
 
 		 642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.12 
 
 		 631 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.16 
 
 		 644 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.79 
 
 		 635 aa  347  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.2 
 
 		 635 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.42 
 
 		 634 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.79 
 
 		 635 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  38.72 
 
 		 636 aa  336  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.92 
 
 		 636 aa  333  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.17 
 
 		 634 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37 
 
 		 644 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.07 
 
 		 636 aa  332  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.5 
 
 		 637 aa  331  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.92 
 
 		 636 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.25 
 
 		 636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.27 
 
 		 636 aa  327  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.51 
 
 		 633 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.36 
 
 		 636 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.62 
 
 		 629 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.75 
 
 		 650 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.2 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  38.47 
 
 		 649 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.05 
 
 		 649 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.18 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.44 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.44 
 
 		 635 aa  290  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.64 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.44 
 
 		 635 aa  286  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.06 
 
 		 649 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37.32 
 
 		 612 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.98 
 
 		 627 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.34 
 
 		 643 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  33.33 
 
 		 657 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.21 
 
 		 648 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  42.19 
 
 		 655 aa  260  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.16 
 
 		 643 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  34.94 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.97 
 
 		 641 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5526  selenocysteine-specific elongation factor  34.95 
 
 		 641 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2095  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.74 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.97 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0712  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.59 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.38 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.38 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.38 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  37.79 
 
 		 641 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.6 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.95 
 
 		 646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.07 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.53 
 
 		 637 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  36.72 
 
 		 651 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  36.72 
 
 		 651 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  36.72 
 
 		 651 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  36.72 
 
 		 651 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.72 
 
 		 641 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.72 
 
 		 641 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  36.72 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.7 
 
 		 637 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.34 
 
 		 641 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.82 
 
 		 643 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.07 
 
 		 643 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0528  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.25 
 
 		 640 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.465523 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.25 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.87 
 
 		 691 aa  220  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0494  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.94 
 
 		 640 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.190998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0537  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.94 
 
 		 640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.82907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.53 
 
 		 605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.24 
 
 		 606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.16 
 
 		 611 aa  212  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.39 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0549  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.85 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.177696 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1381  selenocysteine-specific elongation factor  29.57 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.390422  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1570  selenocysteine-specific elongation factor  29.57 
 
 		 601 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.475266  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0272  selenocysteine-specific elongation factor  23.53 
 
 		 601 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.350191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0106  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.3 
 
 		 673 aa  201  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.65 
 
 		 673 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3580  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.75 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 604 aa  197  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0102  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.7 
 
 		 673 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0107  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.7 
 
 		 673 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35 
 
 		 594 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0110  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.35 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  23.97 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0105  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.98 
 
 		 681 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2264  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.02 
 
 		 580 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.12 
 
 		 583 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0109  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.98 
 
 		 681 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  39.3 
 
 		 590 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  29.26 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.21 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.62 
 
 		 614 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.95 
 
 		 614 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.95 
 
 		 614 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  28.62 
 
 		 614 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3882  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  28.39 
 
 		 616 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>