More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2278 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
408 aa  825    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  75.18 
 
 
426 aa  630  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  69.78 
 
 
409 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.72 
 
 
411 aa  521  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.92 
 
 
410 aa  521  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.22 
 
 
410 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.22 
 
 
410 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.98 
 
 
410 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.48 
 
 
410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.07 
 
 
411 aa  511  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.67 
 
 
412 aa  508  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.04 
 
 
411 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.03 
 
 
411 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  63.05 
 
 
409 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.05 
 
 
411 aa  501  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  63.88 
 
 
410 aa  500  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  62.81 
 
 
410 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  61.23 
 
 
408 aa  495  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.8 
 
 
403 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  53.28 
 
 
423 aa  473  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  50.98 
 
 
415 aa  435  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.99 
 
 
420 aa  425  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.14 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  44.68 
 
 
463 aa  363  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  43.6 
 
 
522 aa  361  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  43.51 
 
 
514 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.93 
 
 
411 aa  355  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.43 
 
 
408 aa  352  7e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.05 
 
 
411 aa  349  5e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.55 
 
 
411 aa  348  7e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  42.44 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  41.84 
 
 
473 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  32.26 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  32.26 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  37.74 
 
 
634 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  31.71 
 
 
397 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  31.52 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  31.28 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.97 
 
 
644 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  30.63 
 
 
396 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  31.52 
 
 
396 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  31.52 
 
 
396 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  31.52 
 
 
396 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  31.94 
 
 
397 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  31.23 
 
 
396 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  31.82 
 
 
396 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  32.43 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.44 
 
 
644 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  30.43 
 
 
396 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  30.43 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  30.51 
 
 
397 aa  136  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  32.56 
 
 
395 aa  136  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  29.3 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  29.3 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  31.45 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  31.41 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.12 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  30.51 
 
 
397 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.69 
 
 
636 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  31.03 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  31.03 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.02 
 
 
619 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.81 
 
 
627 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  31.91 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  31.91 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.91 
 
 
635 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  31.41 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.92 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  30.43 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  31.96 
 
 
399 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  30.29 
 
 
399 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.13 
 
 
657 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  30.2 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.93 
 
 
629 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  32.93 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.44 
 
 
635 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.82 
 
 
636 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  29.68 
 
 
396 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  29.68 
 
 
396 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  30.81 
 
 
396 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  31.42 
 
 
439 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.73 
 
 
627 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  31.03 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  28.86 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  30.77 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  30.79 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  28.86 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  28.86 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  28.86 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  30.46 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  30.46 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  32.42 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  28.32 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  28.32 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  31.61 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  30.32 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.19 
 
 
601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  29.89 
 
 
394 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  29.89 
 
 
394 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>