More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1010 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 		 411 aa  819    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  83.7 
 
 		 408 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  89.05 
 
 		 411 aa  754    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  85.16 
 
 		 411 aa  726    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.18 
 
 		 408 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.04 
 
 		 423 aa  378  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.06 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  43.31 
 
 		 415 aa  348  9e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.26 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.24 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.67 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.57 
 
 		 410 aa  344  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.34 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.32 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.89 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.82 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.39 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.03 
 
 		 415 aa  334  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.05 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.59 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.63 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.67 
 
 		 409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.83 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.32 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.95 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.83 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.54 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  39.39 
 
 		 522 aa  302  8.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  39.91 
 
 		 463 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  38.86 
 
 		 420 aa  299  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  39 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  37.24 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  36.1 
 
 		 514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.92 
 
 		 644 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.62 
 
 		 634 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.48 
 
 		 634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.23 
 
 		 650 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.56 
 
 		 642 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.5 
 
 		 643 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.37 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.97 
 
 		 657 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  29.58 
 
 		 657 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.68 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.24 
 
 		 635 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.17 
 
 		 619 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.09 
 
 		 642 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.75 
 
 		 628 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.65 
 
 		 629 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.69 
 
 		 644 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.92 
 
 		 637 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.07 
 
 		 641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.86 
 
 		 636 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 		 636 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.66 
 
 		 636 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  34 
 
 		 635 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.58 
 
 		 601 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.32 
 
 		 648 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.69 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.99 
 
 		 635 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.14 
 
 		 636 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.5 
 
 		 643 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.52 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.82 
 
 		 636 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.67 
 
 		 649 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.74 
 
 		 627 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.06 
 
 		 631 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.74 
 
 		 635 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.06 
 
 		 637 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.35 
 
 		 633 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.47 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  28.77 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  32 
 
 		 691 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.01 
 
 		 634 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.25 
 
 		 649 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.22 
 
 		 635 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.25 
 
 		 649 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.35 
 
 		 594 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.61 
 
 		 614 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  27.82 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.2 
 
 		 614 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.5 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  29.06 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  29.06 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  29.06 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  29.06 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.07 
 
 		 655 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.2 
 
 		 614 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  33.2 
 
 		 614 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  27.62 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.2 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  27.47 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.78 
 
 		 614 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.2 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  27.91 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.78 
 
 		 614 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.1 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.96 
 
 		 643 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.34 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.2 
 
 		 621 aa  99.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  27.65 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>