More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0078 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  89.05 
 
 		 411 aa  754    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  86.62 
 
 		 411 aa  740    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 		 411 aa  823    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  83.45 
 
 		 408 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.42 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  48.52 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  46.78 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.74 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.03 
 
 		 410 aa  358  9e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.06 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.41 
 
 		 410 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.41 
 
 		 410 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.04 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.54 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.08 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.72 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.49 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.81 
 
 		 409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.63 
 
 		 412 aa  343  5e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.23 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.34 
 
 		 426 aa  339  7e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.93 
 
 		 408 aa  339  7e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.12 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.12 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.68 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.69 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.78 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.7 
 
 		 420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  40.28 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  39.05 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  39.08 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  37.79 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  36.28 
 
 		 514 aa  275  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.48 
 
 		 634 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.48 
 
 		 650 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.62 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.05 
 
 		 644 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.05 
 
 		 642 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.92 
 
 		 635 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.09 
 
 		 643 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.37 
 
 		 636 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  29.14 
 
 		 657 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.14 
 
 		 657 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.46 
 
 		 634 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.22 
 
 		 619 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.48 
 
 		 642 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.74 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.33 
 
 		 635 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.68 
 
 		 644 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.96 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.06 
 
 		 637 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.3 
 
 		 629 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  29.94 
 
 		 641 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.72 
 
 		 631 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.65 
 
 		 636 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.03 
 
 		 635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.23 
 
 		 601 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.79 
 
 		 635 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.55 
 
 		 636 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.07 
 
 		 648 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.93 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.28 
 
 		 635 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.06 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.6 
 
 		 636 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.3 
 
 		 633 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.48 
 
 		 628 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.2 
 
 		 643 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.21 
 
 		 637 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.62 
 
 		 605 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  31.62 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  30.43 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.37 
 
 		 643 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.8 
 
 		 691 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.85 
 
 		 637 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.85 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.696319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.44 
 
 		 614 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  34.44 
 
 		 614 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  30.2 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.44 
 
 		 614 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.44 
 
 		 614 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.06 
 
 		 634 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.02 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.44 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.4 
 
 		 611 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.02 
 
 		 614 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.07 
 
 		 649 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  29.4 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.44 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  34.02 
 
 		 621 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  29.02 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  30.26 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>