More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2243 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  73.61 
 
 
415 aa  663    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
415 aa  843    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54 
 
 
423 aa  457  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  54.32 
 
 
408 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.46 
 
 
409 aa  433  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.74 
 
 
410 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.74 
 
 
410 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.98 
 
 
410 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.25 
 
 
410 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  53.45 
 
 
410 aa  418  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.61 
 
 
411 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.49 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.14 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.61 
 
 
426 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.84 
 
 
420 aa  413  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.75 
 
 
410 aa  410  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.25 
 
 
411 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.12 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  52.22 
 
 
409 aa  402  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.12 
 
 
412 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.14 
 
 
408 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.88 
 
 
411 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.6 
 
 
410 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.34 
 
 
408 aa  359  5e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.98 
 
 
411 aa  350  3e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.49 
 
 
411 aa  344  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  42.08 
 
 
463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  42.55 
 
 
514 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.03 
 
 
411 aa  334  2e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.77 
 
 
408 aa  333  4e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  42.35 
 
 
522 aa  333  5e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  42.55 
 
 
473 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  41.16 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.03 
 
 
644 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 
635 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.37 
 
 
644 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.74 
 
 
629 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.71 
 
 
634 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  28.86 
 
 
397 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  33.1 
 
 
439 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.6 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.2 
 
 
636 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.82 
 
 
634 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.91 
 
 
635 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.06 
 
 
635 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  32.69 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.82 
 
 
627 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.35 
 
 
642 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.2 
 
 
636 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.69 
 
 
619 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  27.73 
 
 
397 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  28.25 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.97 
 
 
627 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.86 
 
 
650 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.14 
 
 
657 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.62 
 
 
628 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.98 
 
 
636 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  30.38 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.6 
 
 
636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  31.69 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  31.69 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  30.82 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  30.94 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  30.82 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  30.94 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  30.82 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.82 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  31.48 
 
 
395 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  30.98 
 
 
395 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  30.98 
 
 
395 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.5 
 
 
643 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  30.82 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.98 
 
 
636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.97 
 
 
643 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.33 
 
 
631 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  27.09 
 
 
396 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  32.47 
 
 
395 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  31.12 
 
 
396 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  31.12 
 
 
396 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.14 
 
 
636 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  29.77 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  33.33 
 
 
396 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  33.33 
 
 
396 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  32.95 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  33.71 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  32.95 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  32.84 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  32.84 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.35 
 
 
648 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  32.58 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  33.71 
 
 
396 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>