More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0382 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  96.59 
 
 
410 aa  802    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
410 aa  824    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  90.24 
 
 
410 aa  759    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  97.32 
 
 
410 aa  808    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  73.59 
 
 
410 aa  630  1e-179  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  62.84 
 
 
408 aa  529  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.98 
 
 
426 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.1 
 
 
409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.98 
 
 
408 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.7 
 
 
411 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.45 
 
 
411 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.85 
 
 
411 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.44 
 
 
410 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.61 
 
 
411 aa  478  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.35 
 
 
423 aa  479  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.6 
 
 
412 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.85 
 
 
403 aa  478  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.19 
 
 
409 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  54.55 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.48 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.73 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.74 
 
 
420 aa  436  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.98 
 
 
415 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  45.86 
 
 
522 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  45.52 
 
 
463 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  44.68 
 
 
514 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  44.9 
 
 
453 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.41 
 
 
411 aa  352  8e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.91 
 
 
408 aa  349  6e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.67 
 
 
411 aa  345  7e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  44.08 
 
 
473 aa  345  8e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.89 
 
 
411 aa  342  7e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.29 
 
 
408 aa  335  1e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.13 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.58 
 
 
650 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.02 
 
 
644 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.69 
 
 
634 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.97 
 
 
644 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.06 
 
 
634 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.6 
 
 
642 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.28 
 
 
634 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.48 
 
 
619 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.28 
 
 
627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.66 
 
 
636 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.55 
 
 
636 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.62 
 
 
628 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.07 
 
 
642 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.88 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.94 
 
 
657 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.87 
 
 
631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.27 
 
 
629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.88 
 
 
612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 
635 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.2 
 
 
565 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.2 
 
 
565 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.74 
 
 
636 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.8 
 
 
570 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
637 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  27.65 
 
 
397 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.44 
 
 
635 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.44 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.41 
 
 
627 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.1 
 
 
636 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.74 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  29.16 
 
 
657 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.18 
 
 
636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  27.92 
 
 
397 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  27.92 
 
 
397 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.1 
 
 
636 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  30.38 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  30.38 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.04 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.55 
 
 
643 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.76 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  31.73 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  28.84 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.94 
 
 
637 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.12 
 
 
648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  30.59 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  31.93 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  30.35 
 
 
430 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.32 
 
 
649 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  29.2 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  31.25 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  31.25 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.17 
 
 
649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  29.3 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  29.55 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.28 
 
 
649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.8 
 
 
637 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  29.55 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  31.25 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  32.23 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  30.88 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  28.85 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  28.85 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  30.88 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.13 
 
 
591 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  27.35 
 
 
399 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000030513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>