More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83918 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  74.65 
 
 		 514 aa  758    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  100 
 
 		 522 aa  1064    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  70.72 
 
 		 463 aa  667    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  66.96 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  63.07 
 
 		 453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.95 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.1 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.1 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.86 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.65 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  46.1 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.02 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.34 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.13 
 
 		 426 aa  360  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.93 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  43.63 
 
 		 415 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.26 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.65 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.48 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.6 
 
 		 408 aa  346  8e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.45 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.01 
 
 		 411 aa  339  8e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.35 
 
 		 415 aa  333  6e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.65 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  42.08 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  41.41 
 
 		 409 aa  316  6e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.76 
 
 		 411 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.24 
 
 		 411 aa  302  9e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.39 
 
 		 411 aa  302  9e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.62 
 
 		 408 aa  302  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.05 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.18 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  38.1 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.98 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.25 
 
 		 634 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.58 
 
 		 635 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.64 
 
 		 619 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.12 
 
 		 650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.5 
 
 		 644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.35 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.3 
 
 		 642 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.24 
 
 		 634 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.02 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.52 
 
 		 635 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.4 
 
 		 628 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.52 
 
 		 636 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.38 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.08 
 
 		 636 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.74 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.91 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.52 
 
 		 634 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.52 
 
 		 636 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.08 
 
 		 636 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.86 
 
 		 643 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.57 
 
 		 604 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.15 
 
 		 635 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.62 
 
 		 627 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.08 
 
 		 629 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.92 
 
 		 643 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.06 
 
 		 643 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.37 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.16 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.37 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.86 
 
 		 635 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.54 
 
 		 657 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  28 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.73 
 
 		 636 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.3 
 
 		 655 aa  100  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.47 
 
 		 635 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.63 
 
 		 627 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  26.34 
 
 		 641 aa  97.8  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.56 
 
 		 636 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5688  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.68 
 
 		 596 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3382  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.57 
 
 		 641 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  28.73 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.3 
 
 		 631 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.03 
 
 		 637 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  28.32 
 
 		 395 aa  94.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.49 
 
 		 591 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16940  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.06 
 
 		 583 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213421  normal  0.332319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.8 
 
 		 648 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  27.44 
 
 		 397 aa  93.6  8e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.9 
 
 		 637 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.12 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.04 
 
 		 649 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  26.56 
 
 		 657 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.96 
 
 		 635 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.66 
 
 		 649 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  28.31 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.44 
 
 		 643 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.66 
 
 		 649 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  26.56 
 
 		 641 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  28.31 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  27.42 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.65 
 
 		 634 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  27.99 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.31 
 
 		 691 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>