More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0387 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 395 aa  646    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  78.23 
 
 		 395 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 395 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 395 aa  646    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 395 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 395 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  78.68 
 
 		 395 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 395 aa  634  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71.32 
 
 		 395 aa  607  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.53 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.53 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 		 398 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  75.38 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.45 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 399 aa  584  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  67.9 
 
 		 405 aa  584  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  67.9 
 
 		 405 aa  584  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.27 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  70.25 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  68.94 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2066  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000429802  normal  0.421241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0287  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 393 aa  577  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  68.33 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  68.94 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  68.94 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.37 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0195  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000854566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1644  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.416574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  68.33 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  68.77 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  68 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  68.77 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  68.77 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0332  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000132948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  68.51 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  68.51 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>