More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2398 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
412 aa  825    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  79.01 
 
 
409 aa  625  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  78.54 
 
 
410 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  78.88 
 
 
410 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  74.27 
 
 
411 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  63.48 
 
 
426 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  64.86 
 
 
409 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.52 
 
 
408 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.84 
 
 
410 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.09 
 
 
410 aa  501  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.6 
 
 
410 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.6 
 
 
410 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  57 
 
 
408 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.77 
 
 
411 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.65 
 
 
410 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.62 
 
 
411 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.74 
 
 
411 aa  481  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.65 
 
 
403 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.04 
 
 
411 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.33 
 
 
423 aa  443  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.5 
 
 
420 aa  425  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  47.94 
 
 
415 aa  410  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.12 
 
 
415 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.77 
 
 
408 aa  363  3e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.48 
 
 
408 aa  362  6e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.63 
 
 
411 aa  362  9e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  44.23 
 
 
514 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.39 
 
 
411 aa  353  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.66 
 
 
411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  41.65 
 
 
463 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  41.65 
 
 
522 aa  346  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  43.07 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  42.72 
 
 
473 aa  335  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.75 
 
 
644 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.22 
 
 
644 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.85 
 
 
634 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.63 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  30.61 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.97 
 
 
619 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.67 
 
 
634 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.76 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.54 
 
 
635 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.59 
 
 
650 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  29.4 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  30.02 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  29.77 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.87 
 
 
631 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.16 
 
 
636 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  29.48 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.62 
 
 
635 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  29.43 
 
 
396 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.12 
 
 
628 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.19 
 
 
637 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  29.21 
 
 
397 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  30.49 
 
 
397 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.77 
 
 
627 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.18 
 
 
637 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.86 
 
 
657 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.96 
 
 
635 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.48 
 
 
642 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.34 
 
 
397 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  29.5 
 
 
397 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.51 
 
 
636 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  29.94 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  29.81 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  30.37 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  28.74 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  30.37 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  30.37 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.77 
 
 
611 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  28.74 
 
 
396 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.11 
 
 
570 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  27.7 
 
 
405 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.11 
 
 
565 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.25 
 
 
657 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  27.7 
 
 
405 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.11 
 
 
565 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  31.69 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.88 
 
 
612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  30.39 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.37 
 
 
627 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  29.29 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  30.23 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.14 
 
 
643 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  30.35 
 
 
396 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  30.35 
 
 
396 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.25 
 
 
396 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.92 
 
 
400 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  26.36 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  26.36 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  32.15 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  32.15 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.15 
 
 
397 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  28.21 
 
 
396 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.48 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  32.48 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  29.66 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  29.66 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.2 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  30.14 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>