More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1389 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  100 
 
 		 415 aa  842    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  73.61 
 
 		 415 aa  663    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.93 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.55 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  53.81 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.55 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.05 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  55.56 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.86 
 
 		 409 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.47 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.46 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.96 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.71 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  53.22 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.49 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.25 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  53.09 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.37 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.98 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  51.96 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.94 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  48.64 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.88 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.03 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.5 
 
 		 411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.74 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  43.63 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  42.38 
 
 		 514 aa  348  8e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.31 
 
 		 411 aa  348  9e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.69 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  42.45 
 
 		 463 aa  345  8e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  43.74 
 
 		 473 aa  344  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  41.26 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  33.44 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  32.29 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.89 
 
 		 634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  32.62 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.33 
 
 		 644 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.1 
 
 		 629 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  33.21 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  31.23 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  31.23 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  31.23 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  32.17 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  30.88 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.71 
 
 		 619 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.61 
 
 		 635 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  33.58 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.47 
 
 		 601 aa  123  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.37 
 
 		 635 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 		 634 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  33.94 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.28 
 
 		 627 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  33.91 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  30.53 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.6 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  31.06 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.8 
 
 		 636 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.14 
 
 		 657 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  29.87 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.43 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.92 
 
 		 628 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  29.43 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.78 
 
 		 631 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  32.61 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.6 
 
 		 644 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  32.2 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  32.2 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.56 
 
 		 642 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.15 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  29.64 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.17 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  31.29 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  29.66 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  31.49 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2298  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0189687  hitchhiker  0.00385898 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  33.22 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  31.62 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  31.86 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  31.86 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  31.86 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.77 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  31.86 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  31.86 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  28.96 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2989  elongation factor Tu  31.21 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  29.76 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  29.76 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  30.41 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  30.1 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  30.1 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  31.19 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0178  elongation factor Tu  31.58 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000251957  normal  0.724836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>