More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1171 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  86.62 
 
 
408 aa  738    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  85.16 
 
 
411 aa  726    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  86.62 
 
 
411 aa  740    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
411 aa  827    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.91 
 
 
408 aa  477  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.01 
 
 
423 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  46.53 
 
 
408 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.5 
 
 
415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.66 
 
 
410 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.05 
 
 
410 aa  354  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.98 
 
 
415 aa  350  3e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.05 
 
 
411 aa  348  9e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.31 
 
 
410 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.67 
 
 
410 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.06 
 
 
410 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.14 
 
 
411 aa  343  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.12 
 
 
409 aa  342  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.59 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.66 
 
 
412 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.5 
 
 
410 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.55 
 
 
408 aa  332  6e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  44.47 
 
 
409 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.85 
 
 
411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.79 
 
 
411 aa  328  9e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.31 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.56 
 
 
411 aa  325  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.91 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.27 
 
 
420 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  39.76 
 
 
522 aa  309  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  39.57 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  40.53 
 
 
453 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  37.47 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  37.24 
 
 
473 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.69 
 
 
634 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.06 
 
 
644 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.81 
 
 
650 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.97 
 
 
635 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.34 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.6 
 
 
634 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.07 
 
 
657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.77 
 
 
636 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.75 
 
 
643 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.87 
 
 
636 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.81 
 
 
634 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.93 
 
 
636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.64 
 
 
601 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.27 
 
 
635 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.72 
 
 
637 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.72 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.68 
 
 
642 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.3 
 
 
629 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.56 
 
 
635 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.33 
 
 
644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.55 
 
 
657 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.61 
 
 
637 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.99 
 
 
636 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.65 
 
 
648 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  34 
 
 
636 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.21 
 
 
635 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.93 
 
 
636 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.62 
 
 
641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.85 
 
 
636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.21 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.95 
 
 
631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.47 
 
 
637 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.45 
 
 
627 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.03 
 
 
634 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3918  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  27.65 
 
 
614 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.696319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.43 
 
 
649 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.04 
 
 
643 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.14 
 
 
397 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.37 
 
 
643 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.16 
 
 
628 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
614 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
614 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03445  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
614 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03396  hypothetical protein  33.74 
 
 
614 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  29.61 
 
 
396 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.48 
 
 
594 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  27.91 
 
 
396 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0123  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
614 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  27.67 
 
 
396 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0118  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.33 
 
 
614 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3795  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.33 
 
 
614 aa  106  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0487  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.47 
 
 
605 aa  106  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.04 
 
 
649 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4005  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
614 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.799296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.04 
 
 
649 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63530  selenocysteine-specific elongation factor  33.6 
 
 
641 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.440984  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.99 
 
 
611 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0141  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.74 
 
 
621 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.645753  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  30.17 
 
 
394 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  30.17 
 
 
394 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.83 
 
 
604 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.13 
 
 
655 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  28.35 
 
 
395 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  30.17 
 
 
394 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  30.17 
 
 
394 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  28.97 
 
 
396 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  28.97 
 
 
396 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>