More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1464 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  91.46 
 
 
410 aa  767    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
410 aa  827    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  98.29 
 
 
410 aa  817    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  96.59 
 
 
410 aa  802    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  73.11 
 
 
410 aa  627  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  62.59 
 
 
408 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.73 
 
 
426 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.1 
 
 
409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.22 
 
 
408 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.2 
 
 
411 aa  500  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.7 
 
 
411 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.35 
 
 
411 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.19 
 
 
410 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.35 
 
 
403 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.86 
 
 
411 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.6 
 
 
412 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.11 
 
 
423 aa  481  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.19 
 
 
409 aa  474  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  53.81 
 
 
415 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  55.75 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  54.48 
 
 
411 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.75 
 
 
420 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.74 
 
 
415 aa  431  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  46.1 
 
 
522 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  45.99 
 
 
463 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  44.92 
 
 
514 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  44.9 
 
 
453 aa  364  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.54 
 
 
411 aa  351  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.25 
 
 
408 aa  349  4e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  43.84 
 
 
473 aa  345  7e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.06 
 
 
411 aa  345  8.999999999999999e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.05 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.82 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.32 
 
 
634 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.13 
 
 
650 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.16 
 
 
635 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.98 
 
 
642 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.61 
 
 
644 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.17 
 
 
627 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.29 
 
 
634 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.73 
 
 
644 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.04 
 
 
634 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.66 
 
 
619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.74 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.22 
 
 
636 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.55 
 
 
636 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.88 
 
 
636 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.01 
 
 
628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.82 
 
 
642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.88 
 
 
612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.94 
 
 
657 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.12 
 
 
565 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.12 
 
 
565 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.5 
 
 
636 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.71 
 
 
570 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.36 
 
 
631 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.09 
 
 
629 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.96 
 
 
637 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.4 
 
 
635 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.93 
 
 
601 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.2 
 
 
611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.29 
 
 
636 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.01 
 
 
627 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  30.09 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  26.96 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  31.31 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.76 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  30.09 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  29.82 
 
 
396 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  28.14 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.1 
 
 
637 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.29 
 
 
636 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  28.84 
 
 
396 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  31 
 
 
395 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.69 
 
 
648 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.99 
 
 
636 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  30.88 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3739  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.38 
 
 
591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267457  normal  0.0215815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.82 
 
 
637 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  30.88 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  30.88 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  31.85 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  32.22 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.16 
 
 
643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  30.69 
 
 
400 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  30.69 
 
 
400 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  29.61 
 
 
399 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0585  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.06 
 
 
604 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  29.61 
 
 
399 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  29.61 
 
 
399 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  29.77 
 
 
430 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  27.58 
 
 
399 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000030513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.72 
 
 
649 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  29.51 
 
 
399 aa  112  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.96 
 
 
655 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  31.64 
 
 
641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  28.67 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  27.92 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>