More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0345 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 399 aa  675    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0345  translation elongation factor Tu  82.66 
 
 		 399 aa  665    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000850527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 399 aa  674    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  79.4 
 
 		 399 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  815    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000030513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  79.4 
 
 		 399 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  80.9 
 
 		 399 aa  674    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  81.95 
 
 		 399 aa  687    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  79.4 
 
 		 399 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.69 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.44 
 
 		 394 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.44 
 
 		 394 aa  621  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  76.38 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  74.44 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>