More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1355 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  81.47 
 
 		 396 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  81.47 
 
 		 396 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 397 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2121  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 396 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3356  elongation factor Tu  81.73 
 
 		 396 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 394 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  76.4 
 
 		 394 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 395 aa  677    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 391 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 391 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 391 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 394 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 391 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  82.74 
 
 		 396 aa  685    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1948  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  634    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4902  elongation factor Tu  81.27 
 
 		 396 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1352  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551093  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 391 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 391 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  82.53 
 
 		 396 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 396 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 396 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  82.99 
 
 		 396 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 396 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 396 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 396 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  86.11 
 
 		 396 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.92 
 
 		 396 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0582  elongation factor Tu  82.83 
 
 		 396 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 396 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 396 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  82.74 
 
 		 396 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.92 
 
 		 396 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.92 
 
 		 396 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  634    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  82.49 
 
 		 396 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 396 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  82.23 
 
 		 396 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  77.16 
 
 		 396 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  78.43 
 
 		 396 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 396 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  79.44 
 
 		 396 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2820  elongation factor Tu  85.39 
 
 		 397 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.298689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 396 aa  634    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  82.53 
 
 		 396 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 391 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2216  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3847  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 394 aa  634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1677  elongation factor Tu  81.73 
 
 		 396 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0620439  hitchhiker  0.0000672774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 394 aa  634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 396 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 391 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 391 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  80.96 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  630  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  630  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0832  elongation factor Tu  80.2 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052918  normal  0.108772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  78.68 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  78.68 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 391 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 400 aa  631  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 400 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  80.2 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  80.2 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.9 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.41 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>