More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2820 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  78.99 
 
 		 396 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 391 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  79.24 
 
 		 396 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  80.4 
 
 		 396 aa  634    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  78.99 
 
 		 396 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  80 
 
 		 396 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  80 
 
 		 396 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 396 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  80.25 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 396 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 391 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 395 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2820  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  804    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.298689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  85.39 
 
 		 396 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  79.24 
 
 		 396 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  80.15 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  80 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 391 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 391 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1948  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0582  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 391 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 391 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1352  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551093  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  74.68 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  74.68 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  73.92 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  73.92 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  80 
 
 		 391 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  80 
 
 		 391 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  77.97 
 
 		 391 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  77.97 
 
 		 391 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 391 aa  614  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>