More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0734 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 396 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0969  elongation factor Tu  85.68 
 
 		 391 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0124791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 391 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 391 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  78.99 
 
 		 396 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  79.04 
 
 		 396 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  80.71 
 
 		 396 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0223  elongation factor Tu  90.79 
 
 		 391 aa  706    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0274  elongation factor Tu  90.79 
 
 		 391 aa  706    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  90.77 
 
 		 391 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 396 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 396 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 396 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  80.81 
 
 		 396 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  88.49 
 
 		 391 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  88.49 
 
 		 391 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  80.81 
 
 		 396 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 391 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0696  elongation factor Tu  85.42 
 
 		 391 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 396 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  78.79 
 
 		 396 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  77.22 
 
 		 396 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0242  elongation factor Tu  89.23 
 
 		 391 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.333301  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2434  elongation factor Tu  89.23 
 
 		 391 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  85.6 
 
 		 391 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  85.6 
 
 		 391 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 396 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  90.77 
 
 		 391 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0563  elongation factor Tu  85.17 
 
 		 391 aa  661    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000014358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0984  elongation factor Tu  85.68 
 
 		 391 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0503391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0664  elongation factor Tu  85.42 
 
 		 391 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000028425  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 395 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 391 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 391 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 396 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>