More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1814 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  82.58 
 
 
391 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  77.97 
 
 
396 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  81.52 
 
 
391 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  79.04 
 
 
396 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  79.04 
 
 
396 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0696  elongation factor Tu  84.34 
 
 
391 aa  656    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  78.79 
 
 
396 aa  653    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0984  elongation factor Tu  85.86 
 
 
391 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0969  elongation factor Tu  85.86 
 
 
391 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0124791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  85.61 
 
 
396 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  85.61 
 
 
396 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  634    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  634    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  84.34 
 
 
396 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  78.03 
 
 
396 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  78.03 
 
 
396 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  81.52 
 
 
391 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  81.52 
 
 
391 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2690  elongation factor Tu  83.08 
 
 
396 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.534989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2702  elongation factor Tu  82.83 
 
 
396 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0762805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  76.83 
 
 
400 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  81.52 
 
 
391 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  85.86 
 
 
396 aa  698    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  85.86 
 
 
396 aa  698    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  81.98 
 
 
396 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  78.48 
 
 
396 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  85.86 
 
 
396 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  79.29 
 
 
396 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  79.04 
 
 
396 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  79.04 
 
 
396 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  79.04 
 
 
396 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  86.11 
 
 
396 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  86.11 
 
 
396 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  83.84 
 
 
396 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  80.51 
 
 
396 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0242  elongation factor Tu  84.81 
 
 
391 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.333301  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2434  elongation factor Tu  84.81 
 
 
391 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.349806  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  80.51 
 
 
396 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  84.85 
 
 
391 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  84.85 
 
 
391 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  81.77 
 
 
391 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0664  elongation factor Tu  84.34 
 
 
391 aa  656    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000028425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  81.77 
 
 
391 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  82.58 
 
 
391 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1677  elongation factor Tu  82.83 
 
 
396 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0620439  hitchhiker  0.0000672774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0563  elongation factor Tu  84.09 
 
 
391 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000014358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  77.97 
 
 
396 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  100 
 
 
396 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  100 
 
 
396 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  82.83 
 
 
391 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  82.83 
 
 
391 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  79.44 
 
 
395 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  84.85 
 
 
396 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  83.33 
 
 
391 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>