More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0555 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0696  elongation factor Tu  81.59 
 
 
391 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0664  elongation factor Tu  81.59 
 
 
391 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000028425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  87.69 
 
 
391 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1837  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  77.58 
 
 
397 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0274  elongation factor Tu  93.09 
 
 
391 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  87.18 
 
 
391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  87.18 
 
 
391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1315  elongation factor Tu  81.59 
 
 
391 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  80.3 
 
 
396 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1812  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  77.58 
 
 
397 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  87.18 
 
 
391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  87.18 
 
 
391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  80.3 
 
 
396 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  78.68 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  80.71 
 
 
396 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  100 
 
 
391 aa  795    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  100 
 
 
391 aa  795    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  79.29 
 
 
396 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  79.55 
 
 
396 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0984  elongation factor Tu  83.38 
 
 
391 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0969  elongation factor Tu  83.38 
 
 
391 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0124791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0223  elongation factor Tu  93.09 
 
 
391 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  79.29 
 
 
396 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  80.05 
 
 
396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  88.49 
 
 
391 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0563  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  634    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000014358  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0242  elongation factor Tu  90 
 
 
391 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.333301  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2434  elongation factor Tu  90 
 
 
391 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.349806  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  80.3 
 
 
396 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  87.18 
 
 
391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  88.49 
 
 
391 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  82.35 
 
 
391 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  82.35 
 
 
391 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  81.33 
 
 
391 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  78.43 
 
 
396 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  87.69 
 
 
391 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  78.68 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  83.33 
 
 
396 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  83.33 
 
 
396 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1330  elongation factor Tu  81.59 
 
 
391 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262111  normal  0.0428037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  80.31 
 
 
391 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  77.53 
 
 
396 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  633  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1428  elongation factor Tu  80.56 
 
 
391 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00224702  decreased coverage  0.00405593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1413  elongation factor Tu  80.56 
 
 
391 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  80.31 
 
 
391 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  76.2 
 
 
396 aa  624  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  76.01 
 
 
396 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  75.82 
 
 
400 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  76.01 
 
 
396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  76.01 
 
 
396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  75.82 
 
 
397 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  75.82 
 
 
397 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>